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Détermination du sexe de haute précision à l'aide de l'indice de forme de l'œuf

Sep 01, 2023Sep 01, 2023

Rapports scientifiques volume 13, Numéro d'article : 504 (2023) Citer cet article

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Étant donné que seuls les poussins femelles sont utilisés dans les poules pondeuses, les poussins mâles généralement éclos sont tués. On estime qu'environ 7 milliards de poussins par an sont tués immédiatement après l'éclosion. En plus d'être contraire à l'éthique, cette situation entraîne également de grandes pertes financières. La détermination du sexe des poussins peut être effectuée avant ou après l'éclosion. Bien entendu, les déterminations faites avant l'éclosion sont plus avantageuses, mais le taux de prédiction est relativement faible. La morphologie d'un œuf est exprimée en termes d'indice de forme (SI), qui est le rapport du diamètre court au diamètre long. Dans cette étude, les poussins mâles et femelles ont été prédits en utilisant l'indice de forme des œufs à l'aide du classificateur RUSBoost utilisant l'indice de forme. Bien que le SI variait selon le type d'œuf, une corrélation significative (r = 0,78) a été observée entre le sexe des poussins et le SI. Par conséquent, il a été possible d'estimer le sexe en utilisant le SI chez les poulets, même si la précision de la classification n'était pas aussi élevée que chez les canards. Outre le SI, les paramètres de masse, petit axe, grand axe, ovalité, volume, excentricité ont été obtenus et utilisés pour les résultats. Avec ces caractéristiques, les femmes sont classées à 80 % et les hommes à 81 % correctement. Les prédictions du modèle ont été appliquées à l'équation de probabilité d'éclosion des poussins femelles des études précédentes, 71 % des estimations ont été correctement classées selon cette équation. Avec ce travail, environ 80 % des prédictions précises ont été faites. Dans ce cas, la mort de 5,65 milliards de poussins peut être évitée. De même, de nombreux œufs ne sont pas gaspillés. Une perte de 1,13 milliard USD peut être évitée.

Des activités d'alimentation et d'élevage sont menées pour fournir les nutriments nécessaires à la population mondiale en croissance rapide. Le secteur des œufs est l'un des principaux secteurs dans le monde. Pour augmenter la production d'œufs, des études d'élevage sont menées et les études sur les poulets se poursuivent. Pour des raisons d'efficacité, les espèces de poulets de chair et de pondeuses ont été sélectionnées pour la reproduction selon différentes caractéristiques. Les poulets de chair grandissent rapidement et sont prêts à être coupés en peu de temps. D'autre part, les couches ne poussent pas aussi vite et ne seront pas lourdes lorsqu'elles se développeront. Les nombres d'œufs de poule mâles et femelles sont proches l'un de l'autre1. La présence de poussins mâles dans la filière œufs est un problème majeur. Ils ne fabriquent pas d'œufs et ne réalisent aucun profit lorsqu'ils sont élevés et vendus pour l'abattage. Par conséquent, les poussins mâles sont sélectionnés par les sexeurs et sont abattus de manière contraire à l'éthique en utilisant différentes méthodes telles que l'abattage, l'étranglement au gaz ou l'étranglement dans un environnement sans oxygène lorsqu'ils viennent d'éclore. Une minorité sont peintes et vendues dans les animaleries2.

En supposant que les poussins mâles ne soient pas séparés, ils consommeront beaucoup d'aliments jusqu'à l'abattage et le revenu reçu après l'abattage sera bien inférieur à la dépense. Un coq mange en moyenne cent grammes de nourriture par jour. Dans une ferme qui a 100 K poulets, dans le cas où les coqs ne sont pas séparés, 100 K coqs prendront place dans la ferme. Seule la masse alimentaire quotidienne des coqs sera de 10 K kg. Considérant que les coqs mangent un aliment au prix de 1 USD par kilogramme, 10 000 USD par jour signifient que seul l'argent de l'alimentation ira aux coqs. En revanche, le prix au kilogramme de leur viande sera au maximum de 2 USD et il sera de 2 kg lorsqu'ils se développeront. S'il n'y a pas de gaspillage à la fin de la consommation moyenne d'aliments sur 6 mois, 2 USD * 2 kg * 100 K pièces = 400 K USD de revenu seront obtenus. En revanche, 10 000 USD * 6 mois * 30 jours = 1 800 000 USD de dépense. Dans ce cas, il y a une perte de 1.400 K USD.

Le nombre d'oiseaux par unité de surface est déterminant pour leur santé et leur rentabilité3. Il devrait y avoir 6 à 7 poulets par mètre carré4. Environ 15 500 m2 d'espace supplémentaire sont nécessaires pour 100 K coqs. Si l'on calcule que 100 K coqs éclosent de tous les œufs sans gaspillage, 100 K œufs sont éclos. En supposant qu'un œuf moyen coûte 0,2 USD, cela signifie une perte de 20 000 USD en raison des dépenses en œufs. 7 milliards de poussins mâles sont abattus chaque année dans le monde2. Il s'agit d'une perte de 1,4 milliard de dollars. En plus de tout cela, des pertes économiques se produiront dans de nombreux éléments tels que l'utilisation d'incubateurs supplémentaires, l'énergie électrique supplémentaire dépensée pour l'incubateur et le nombre de personnes à travailler.

Au couvoir, les sexeurs séparent les poussins en mâles et femelles. Dans le secteur des œufs, parce que seules les poules femelles sont utiles, il est nécessaire de les séparer. Le sexe du poussin peut être déterminé en trois étapes différentes. Il s'agit de la détermination du sexe avant l'incubation, pendant l'incubation et après l'incubation. Dans ce travail, la détermination du sexe avant l'incubation est utilisée car c'est la méthode la plus utile pour sauver la vie du poussin à l'intérieur ou des œufs éclos et pour éviter le gaspillage d'œufs.

Il est possible de déterminer le sexe avec une grande précision avant l'incubation des œufs, et la mesure la plus déterminante dans cette méthode est l'indice de forme des œufs5,6,7,8,9,10. En 7, 300 œufs White Nick Super Layer ont été examinés avec une méthode de régression non supervisée, et la probabilité d'éclosion des femelles a été suggérée. En 8, 340 œufs de cane de Pékin ont été étudiés et un coefficient de corrélation positif de 0,71 a été trouvé. En 9, 103 œufs de cane ont été examinés et une précision de 86 % a été obtenue. En 10, 503 œufs de cane ont été utilisés avec différents algorithmes d'apprentissage automatique et une précision de 87 % a été obtenue. Il existe différentes techniques, telles que l'utilisation de la fluorescence11,12, la spectroscopie Raman13, l'indice de forme des œufs8, l'ADN glycosylase14, pour détecter le sexe des poussins. A l'exception des méthodes morphologiques, toutes les méthodes nécessitent des outils compliqués, coûteux et les œufs sont perforés. Les méthodes de sexage des œufs in ovo ne sont applicables que pendant l'incubation, par conséquent, les œufs mâles sont gaspillés. La méthode de l'indice de forme peut être applicable avant l'incubation ; ainsi les œufs mâles peuvent être vendus sur le marché pour la consommation quotidienne. De plus, la première période des méthodes in-ovo est le neuvième jour de l'incubation; par conséquent, les sources seront toujours utilisées et les poussins vivants dans leurs œufs seront abattus. Il existe un besoin pour une méthode de travail rapide, fiable et applicable dans l'industrie sur les races de poulet. Pour ces raisons, les dispositifs industriels de sélection in ovo ne sont toujours pas pleinement applicables dans l'industrie avicole. Les études qui ont utilisé la méthode de l'indice de forme portent principalement sur des canards, mais les modèles d'œufs de canard ne peuvent pas être appliqués aux œufs de poule en raison de leur morphologie différente. Dikmen7 a suggéré une analyse de régression, au lieu d'un modèle de classification. Nous proposons notre modèle de classification pour les races de poulets, qui n'endommage pas les œufs et est très rapide.

Dans cette étude, la détermination du sexe à l'aide de l'indice de forme de l'œuf est préférée car les autres méthodes sont à la fois coûteuses et difficiles à utiliser dans l'analyse en série. L'indice de forme (SI) est le rapport du diamètre court de l'œuf au diamètre long15,16. En général, les œufs à faible indice de forme seront des poussins mâles, les œufs à indice de forme élevé seront des poussins femelles. En général, les œufs sont de deux types, de forme ovale et de forme pointue, comme le montre la figure 1.

Œuf de forme ovale pour les poussins femelles (à gauche) et œuf de forme pointue pour les poussins mâles (à droite).

L'indice de forme (SI) est le rapport du diamètre court de l'œuf au diamètre long. Lors de l'utilisation de l'indice de forme de l'œuf, l'écart type de l'indice de forme est assez faible. (0,03844 mm dans 60 œufs) La discrimination sexuelle est donc très difficile. Par conséquent, il a été décidé d'utiliser différentes méthodes de comparaison. De cette manière, une éventuelle comparaison des performances était visée. Les résultats obtenus seront comparés au sexe des poussins à couver et la méthode la plus précise sera déterminée.

Conformément à toutes ces conditions, les modalités suivantes ont été décidées :

Classification par sexe avec un algorithme d'apprentissage supervisé. RUSBoosted a été utilisé dans cette étude.

Déterminez l'indice de forme en mesurant directement l'axe court et long de l'œuf et la discrimination sexuelle en fonction de la valeur seuil.

Spécifiez à la fois l'excentricité (SI automatique) et l'indice de forme à axe court et long (SI manuel) à l'aide de MATLAB Image Processing Toolbox. Avec cette étude, la relation entre l'indice de forme des œufs et le sexe des poussins a été remise en question et les résultats ont été répertoriés.

L'expérience a été réalisée dans les couvoirs de l'Université d'Aksaray conformément aux réglementations nationales sur le bien-être et la protection des animaux utilisés à des fins expérimentales et à d'autres fins scientifiques. Les œufs pour l'expérience ont été achetés dans les fermes avicoles locales. La morphologie d'un œuf varie selon la race de poulet et dans la basse-cour locale, la ferme avait un troupeau hybride. Des images d'œufs ont été prises avant l'incubation. Les œufs ont été serrés par leur axe long et des outils d'alignement de cambrure ont été utilisés pour pondre les œufs avec la plus grande précision. (Mitutoyo 06 389 100, précision 0,01 mm) Chaque œuf a reçu un numéro identique (de 0 à 60), et son numéro d'identification a été écrit sur les œufs et leurs cellules de plateau d'incubation correspondantes avec un marqueur. Tout d'abord, les œufs d'incubation de 18 jours ont été classés par ordre numérique, cependant, les plateaux d'incubateur des 3 derniers jours ont été divisés en cellules pour le suivi des poussins. Il est crucial pour l'appariement sexuel entre les œufs et les poussins dans l'apprentissage supervisé. La figure 2 montre la structure cellulaire dans le plateau d'incubation. Pour le processus de division des plateaux, des matériaux en filet ont été obligés d'utiliser en raison de la circulation d'air. Après l'éclosion, les poussins étaient âgés d'une semaine, les distinguer a été fait par inspection visuelle en fonction de leur taille corporelle, de la couleur de leur crête et de leur plumage.

Structure de plateau d'incubation divisé.

La masse est mise à l'échelle avec l'échelle sensible Diheng THR219 0,01 g et enregistrée. Pour les mesures physiques, petit axe |CD|, grand axe |AB|, et le point maximum |AE| (à l'endroit où le côté bosselé (point C) touche le pied à coulisse) est mesuré avec un pied à coulisse numérique sensible de 0,01 mm. Dans des études antérieures, l'indice de forme (SI) est utilisé7,8,16. Le Shape Index est le rapport de l'axe court sur l'axe long et sur la Fig. 3 :

Alignement d'un œuf. Partie arrondie (A), partie pointue (B), points de largeur maximale (C et D), points focaux (F1 et F2), point de croisement (E).

L'indice de forme peut varier entre 0 et 1. 0 fait référence à une ligne et 1 fait référence à un cercle parfait. L'ovalité a été créée comme paramètre dans cette étude. |CD| segment de ligne dans la Fig. 3 représente la largeur maximale de l'œuf. L'ovalité est décrite comme

Si l'œuf est une ellipse parfaite, le point E est placé au milieu de |AB| la ligne et l'ovalité devient 0,5.

L'adresse du dossier d'image a été ajoutée à MATLAB. L'extension de fichier ".jpg" a été utilisée pour les images.

Dans une boucle jusqu'au nombre d'images, les photos ont été lues (imread) et ont été redimensionnées à 540–720 pour un traitement rapide des images de lecture (imresize).

Les images RVB à 3 canaux ont été converties en images grises à un seul canal (rgb2gray). Les images grises à canal unique ont été converties en une image logique en noir et blanc (im2bw) avec du blanc en dessous du seuil et du noir au-dessus. La valeur seuil de chaque image n'étant pas la même, une étude a été réalisée sur la valeur seuil et 2 valeurs seuils différentes ont été obtenues. Le premier était le seuil gris et le second était la moyenne de l'image grise. Les images en noir et blanc résultantes ont été enregistrées pour analyse (imwrite).

Les valeurs d'axe long, d'axe court et d'excentricité des images en noir et blanc ont été obtenues en utilisant la fonction "regionprops". L'indice de forme a été obtenu à partir des données de l'axe court et de l'axe long (indice de forme automatique). L'excentricité est le rapport de la distance entre les foyers de l'ellipse et la longueur de son axe principal et peut être représentée dans l'équation (3) comme 16, 17, 18 :

La valeur est comprise entre 0 et 1. (si l'excentricité d'une ellipse, c'est en fait un cercle, si l'excentricité d'une ellipse est de 1, c'est un segment de droite17,18. L'indice de forme obtenu, l'excentricité, l'axe court et l'axe long ont été enregistré dans le fichier Excel ".xlsl" pour étude (xlswrite). Après avoir créé le fichier Excel et les paramètres fondamentaux, certains paramètres supplémentaires ont été créés pour une inspection plus approfondie. Formule de surface19 :

La surface a été obtenue en utilisant l'équation ci-dessus. La surface et le volume peuvent être transformés à partir de la géométrie de l'ovale. Formule pour obtenir le volume à partir de la surface19 :

Obtenu à l'aide de la formule. Densité à partir des informations de masse et de volume :

Obtenu avec la formule. Il existe plus d'une formule pour le volume d'œufs, mais la formule qui minimise l'écart type de la densité d'œufs (0,000781369) a été utilisée. Probabilité d'éclosion d'œufs femelles7 :

Toutes les valeurs mesurées ont été enregistrées sur Microsoft Office Excel 2021 Professional et d'autres calculs ont été effectués sur cette plateforme. La masse (m), le grand axe (L), le petit axe (W), l'indice de forme (SI), la probabilité de croissance des poussins femelles, la surface (S), le volume (V), la densité (d), les valeurs d'ovalité ont été calculées pour 60 œufs et les valeurs minimales, maximales, moyennes et d'écart type de chaque paramètre ont été calculées.

Comme nous connaissions les sexes réels des poussins, donc des œufs, des méthodes de classification supervisée ont été utilisées. Nous avons formé les arbres RUSBoosted sur MATLAB. L'algorithme d'arbres RUSBoost est une technique de classification pour apprendre à partir de données d'entraînement désordonnées. Cet algorithme offre une alternative plus simple et plus rapide à SMOTEBoost, qui est un autre algorithme combinant boosting et échantillonnage de données20. Le coefficient de corrélation de toutes les variables a été trouvé avec la fonction intégrée Matlab corrcoef(). Avec cette fonction, la matrice des coefficients et la matrice des valeurs p ont été obtenues. La matrice des valeurs de p pour tester l'hypothèse qu'il n'y a pas de relation entre les phénomènes observés. Les résultats généraux et les informations sont présentés dans le tableau 1.

Les caractéristiques du modèle au total 8 se composent de la masse, de l'axe court, de l'axe long, de l'indice de forme de l'étrier, de l'indice de forme de MATLAB, de l'excentricité de MATLAB et de l'ovalité. Les deux valeurs SI car elles ne se chevauchent pas complètement. La validation croisée a été maintenue à 5 pour éviter le surajustement dans nos données limitées. L'analyse en composantes principales (ACP) a été maintenue fermée. Les caractéristiques et leurs descriptions sont présentées dans le tableau 2.

La matrice de confusion a été créée en fonction des résultats obtenus à partir du logiciel en utilisant l'indice de forme. La matrice de confusion affiche le nombre total d'observations dans chaque cellule. Les lignes de la matrice de confusion correspondent à la vraie classe et les colonnes correspondent à la classe prédite. Les cellules diagonales et hors diagonale correspondent respectivement à des observations correctement et incorrectement classées. La matrice de confusion de nos données prédites est illustrée à la Fig. 4.

La matrice de confusion pour toutes les classes. Les rangées représentent le sexe réel des poussins qui ont été déterminés après l'éclosion, les colonnes représentent les sexes classés. Chaque trimestre représente la précision correspondante. Par quarts, en haut à gauche : 76 % des femmes ont été classées correctes, en bas à gauche : 24 % des femmes ont été classées dans l'erreur, en haut à droite : 15 % des hommes ont été classés dans l'erreur, en bas à droite : 85 % des hommes ont été classés corrects.

Après la prédiction, les femmes ont été classées exactes à 80 % et les hommes, exacts à 81 %. Dans l'étude sur les canards9, il a été constaté dans notre étude que les mâles ont une probabilité d'éclosion plus élevée que les femelles.

Du côté des prédictions, si notre modèle estime qu'un œuf est un mâle, il sera précis à 85 %, et s'il prédit une femelle, il sera précis à 76 %. Cela signifie que si notre modèle un œuf est un mâle et l'autre une femelle, ils ne sont pas également fiables. Une faible valeur d'indice de forme signifie une très faible probabilité de contenir un poussin femelle, mais si nous avons un œuf à indice de forme élevé, il peut contenir un œuf mâle avec une chance comparativement plus élevée.

À la fin de la période d'incubation, quarante-sept poussins ont éclos sur 60 œufs. Huit des œufs non éclos n'étaient pas fécondés et 5 d'entre eux étaient morts en coquille, comme déterminé par mirage. Tous les œufs non éclos ont été tenus à l'écart de l'évaluation. Le sexage des poussins a été fait pour quarante-sept poussins vivants. Les œufs femelles, mâles et non éclos sont présentés dans le tableau 3.

La courbe ROC montre la relation entre le taux de vrais positifs (TPR) du modèle et le taux de faux positifs (FPR). Le TPR est le taux auquel le classificateur prédit "positif" pour les observations qui sont "positives". Le FPR est le taux auquel le classificateur prédit "positif" pour les observations qui sont en fait "négatives". Un classificateur parfait aura un TPR de 1 et un FPR de 0. Cette analyse est principalement utilisée pour les classifications binaires. Dans notre étude, les classes binaires sont masculines et féminines. Le graphique d'analyse ROC pour les hommes est illustré aux Figs. 5a et pour les femmes, il est illustré à la Fig. 5b. Le calcul de l'aire sous la courbe (AUC) a une signification significative dans les graphiques.

Analyse ROC pour la classe masculine (a) et la classe féminine (b).

Les tracés de coordonnées parallèles (PCP) sont idéaux pour comparer de nombreuses variables ensemble et voir les relations entre elles. Ce type de visualisation est utilisé pour tracer des données numériques multivariées.

La figure 6 montre le graphique PCP pour les caractéristiques traitées et trace leur distribution. Les descriptions des caractéristiques sont présentées dans le tableau 2. Comme indiqué dans le tableau, la masse et l'axe long ont la plage la plus large. Le croisement entre l'excentricité automatique et l'IS automatique était attendu, nous savons qu'un SI faible correspond à une excentricité élevée par leurs définitions.

Le tracé des coordonnées parallèles montre la relation entre les variables. Toutes les fonctionnalités sont normalisées.

La relation entre la masse et l'axe long est illustrée à la Fig. 7, et il est montré qu'il existe une corrélation positive entre les paramètres. Ce résultat était attendu par les études précédentes7,8,9,15,16,19. Les points de croisement correspondent à une prédiction incorrecte. Les œufs avec des valeurs d'axe plus longues, donc plus gros, étaient censés avoir une masse plus élevée. Si un œuf a la même masse, mais un axe long plus court, cela signifie que l'axe court est plus élevé, ce qui signifie un indice de forme plus élevé, et est prédit comme une femelle plus probable. La relation entre les index courts et longs est illustrée à la Fig. 8.

Corrélation entre masse et grand axe (r = 0,76).

La relation entre les index courts et longs. (r = 0,45).

Nous pouvons voir quelques grappes sur la Fig. 8, cela peut être dû à différentes races de poulets. Il est clair qu'il existe une corrélation positive, mais le taux est très faible.

Dans cette étude, un total de 60 œufs utilisés, et seulement 47 d'entre eux ont éclos. Ce nombre est relativement faible et un grand nombre de données est nécessaire pour obtenir de meilleurs résultats. Des œufs aléatoires ont été choisis dans des fermes locales en tant que races et âge des poulets. Si une race et un âge spécifiques doivent être utilisés dans de futures études, cela pourrait donner de meilleurs résultats. La forme d'un œuf peut varier selon la race de poulet. Au cours de la croissance de la poule pondeuse, la masse d'œufs augmente, cependant cette croissance n'est pas homogène. Au fur et à mesure que la poule vieillit, son œuf grossit vers l'axe court, et non vers l'axe long, ce qui modifie directement l'indice de forme.

La moyenne des estimations (0,5017) a été considérée comme la valeur seuil. Les valeurs d'estimation inférieures au seuil sont considérées comme masculines, au-dessus du seuil, sont considérées comme féminines. 37 poussins sur 47 (0,787) ont été classés correctement.

80,85 % signifie que nous pouvons sauver 5,65 milliards sur 7 milliards de poussins mâles tués. Ceci, en plus de sauver des vies de poussins, signifie que le profit moyen de 20 cents21 est calculé comme 1,13 milliard USD par an.

Par la méthode déductive, l'image d'un grand nombre d'œufs est prise et incubée. Les images d'œufs, qui sont numérotées en fonction des valeurs de sexe obtenues à partir de l'incubation, sont classées et transmises au filet pour formation et le filet est formé. Cependant, cette méthode nécessite un grand nombre d'œufs à couver, un personnel suffisant pour les mesures et un grand incubateur. Dans l'étude, il a été déterminé qu'il y avait une forte corrélation entre l'indice de forme et le sexe. Dans la prochaine étape, il est prévu de transformer la conception en une machine et de séparer les œufs qui ont une forte probabilité d'être des femelles.

Les données sont disponibles sur demande auprès de l'auteur correspondant.

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Département de génie électrique et électronique, Université d'Aksaray, Aksaray, Turquie

Muhammed Kayadan et Yunus Uzun

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MK a préparé le système expérimental et les équipements. Il a fait l'analyse et les simulations.YU a fait les expériences et a écrit l'article.Les figures et les tableaux ont été préparés par MK et YUAtous les auteurs ont revu le manuscrit.

Correspondance à Yunus Uzun.

Les auteurs ne déclarent aucun intérêt concurrent.

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Réimpressions et autorisations

Kayadan, M., Uzun, Y. Détermination du sexe de haute précision à l'aide de l'indice de forme de l'œuf. Sci Rep 13, 504 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-27772-4

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Reçu : 21 août 2022

Accepté : 06 janvier 2023

Publié: 10 janvier 2023

DOI : https://doi.org/10.1038/s41598-023-27772-4

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